Η Περιφέρεια Θεσσαλίας διαιρείται σε πέντε περιφερειακές ενότητες, στους οποίους υπάγονται οι 25 δήμοι της. Οι Π.Ε. ταυτίζονται γεωγραφικά με τους αντίστοιχους νομούς, εκτός από τον νομό Μαγνησίας, ο οποίος διοικητικά μοιράστηκε στις Π.Ε. Μαγνησίας και Σποράδων.
Συνιστάται από τις παρακάτω Περιφερειακές Ενότητες:
- Περιφερειακή Ενότητα Καρδίτσας
- Περιφερειακή Ενότητα Λάρισας
- Περιφερειακή Ενότητα Μαγνησίας
- Περιφερειακή Ενότητα Σποράδων
- Περιφερειακή Ενότητα Τρικάλων
Νέα Περιφέρειας